Équipe IMIS - Imagerie Multimodale Intégrative en Santé

Jean-Paul Armspach

De Équipe IMIS - Imagerie Multimodale Intégrative en Santé
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Coordonnées

Jean-Paul ARMSPACH

Jean-Paul ARMSPACH
Université de Strasbourg/Faculté de Médecine
Institut Physique Biologique- ICube
4, rue Kirschleger
F-67085 Strasbourg Cedex (FRANCE)

Téléphone : (+33) (0) 3 68 85 40 41
Né le : 14 Février 1955

Adresse électronique : jparmspach@unistra.fr
Internet : http://icube-imis.unistra.fr/index.php/Jean-Paul_Armspach

Titres universitaires

Année Diplôme Etablissement Ville
1975 D.U.T. Université Haute Alsace Mulhouse
1978 Ingénieur spécialisation génie électrique INSA Lyon
1982 Docteur Ingénieur Titre : Etude et réalisation d'un appareil de tomographie par RMN du proton. INSA Lyon
1992 Doctorat d'état Titre : Analyse des images RMN pour la caractérisation des tissus. Université Louis Pasteur Strasbourg

Parcours professionnel

Lieu/Grade Année Fonctions
Institut Physique Biologique (IPB)
Ingénieur		 1979 à 1982 Conception et réalisation du premier appareil d'imagerie par résonance magnétique nucléaire en France permettant de visualiser des petits objets (orange, champignon, avant-bras, ..)
Faculté de Médecine – Institut Physique Biologique (IPB)
Ingénieur d'études		 1982 à 1992 Responsable du service informatique de la Faculté de Médecine.
Recherche dans le domaine de l'analyse du signal RMN pour la caractérisation des tissus par IRM.
Institut Physique Biologique – CNRS UMR 7004
Ingénieur de recherche		 1993 à 2006 Responsable du groupe de recherche en Traitement d'Images Médicales.
LINC-IPB UdS/CNRS UMR 7237
Ingénieur de recherche		 2007 à 2012 Responsable de l'équipe de recherche « Imagerie In Vivo ».
Directeur de la plate-forme d’imagerie in vivo de strasbourg – campus médecine.
ICube-IPB UdS/CNRS UMR 7357
Ingénieur de recherche		 2013 à Responsable de l'équipe de recherche « Imagerie Multimodale Intégrative en Santé (IMIS) ».

Directeur de la plate-forme d’imagerie "Imagines".
Membre du comité de direction de ICube.
Membre du bureau de ICube.

Thématiques de recherche

  • Traitement d'images médicales.
  • Détection statistiques de changement en imagerie multi-modales 3D+t.
  • Instrumentation en imagerie IRM.

Directeur de thèses

  • Lucas Soustelle. Imagerie de la myéline par IRM à temps d’écho ultra-court. Co-direction de thèse avec Francois Rousseau. Co-encadrement avec Paulo Loureiro de Sousa (depuis octobre 2014). Financement : contrat doctoral UdS.
  • Laetitia Digeorgis. Analyse des réseaux cérébraux par IRM quantitatives et spectroscopie RMN chez des modèles souris de pathologies neurodégénératives. Co-direction de thèse avec Frédéric Blanc. Co-Encadrement L. Harsan. (depuis octobre 2015). Financement : Bourse région - contrat Fondation Unistra.
  • Argheesh Bhanot. Détection de changements multipoints en IRM multi-séquences du petit animal. Co-direction de thèse avec Fabrice Heitz. Co-Encadrement L. Harsan et Céline Meillier. (depuis octobre 2017). Financement : contrat doctoral.

Directeur de thèses soutenues

  • Marion Sourty. Analyse de la dynamique temporelle et spatiale des réseaux cérébraux spontanés obtenus en imagerie par résonance magnétique fonctionnelle IRMf. Co-direction de thèse avec Jack Foucher. Co-encadrement avec Laurent Thoraval (thèse soutenue 2016).
  • Valérie Wolff (PH - HUS). Physiopathologie et thérapeutique de l’infarctus cérébral du sujet jeune : rôle de la résine de cannabis dans l’atteinte vasculaire et l’altération mitochondriale cérébrale. (thèse soutenue 2014).Co-direction de thèse avec Bernard Gény. .
  • Antoine Grigis. Détection de changements en IRM de diffusion et du tenseur de diffusion. Application à la détection aux pathologies cérébrales. (thèse soutenue 2012 : co-encadrement avec F. Heitz , ICube et V. Noblet , ICube ).
  • Meriam Koob. Etude de la substance blanche cérébrale de l'enfant par imagerie en tenseur de diffusion. (thèse soutenue le 12 Avril 2012 : co-encadrement avec JL. Dietemann , ICube )
  • Akram Belghith. Indexation de spectres HSQC et d'images IRMf appliquée à la détection de bio-marqueurs. (thèse soutenue le 30 Mars 2012 : co-encadrement avec C. Collet , ICube )
  • Swati Sharma. Estimation de l'atrophie cérébrale en imagerie par résonance magnétique : Application à la sclérose en Plaques (thèse soutenue en Septembre 2011 : co-encadrement avec F. Heitz , ICube et F. Rousseau, ICube ).
  • Hervé Boisgontier. Detection automatique de changements en IRM de diffusion : Application à l'étude longitudinale en sclérose en plaques. (thèse soutenue en Juillet 2010 : co-encadrement avec F. Heitz , ICube et V. Noblet , ICube ).
  • Stéphanie Bricq. Segmentation d'images IRM anatomiques multimodales couplant inférence bayésienne et modèles a priori de haut niveau. (thèse soutenue en novembre 2008 : co-encadrement avec C. Collet , ICube ).
  • Matthieu Brucher. Présentations compactes et apprentissage non supervisé de variétés non linéaires. Application au traitement d'images. (thèse soutenue en Octobre 2008 : co-encadrement avec F. Heitz , ICube et C. Heinrich , ICube ).
  • Vincent NOBLET. Atlas statistique anatomique du cerveau humain. Application au recalage, à la segmentation et à l'aide au diagnostic. (thèse : soutenue en Mars 2006).
  • Sylvain Faisan. Analyse et fusion markovienne de séquences en imagerie 3D+t. Application à l'analyse de séquences d'images IRM fonctionnepicabialles cérébrales (thèse : soutenue en Décembre 2004).
  • Torbjorn Vik. Modèles statistiques d'apparence 3D. Application à la création d'un atlas probabiliste de perfusion cérébrale pour l'aide au diagnostic. (thèse : soutenue Septembre 2004).
  • Marcel Bosc. Détection de changements dans des séquences d'images médicales 3D multimodales. Application à la détection et au suivi des lésions du cerveau en sclérose en plaques. (thèse : soutenue en Décembre 2003).
  • Olivier Musse. Construction d'un atlas anatomique numérique probabiliste du cerveau humain en vue d'automatiser la localisation et l'étiquetage de régions anatomiques (thèse : soutenue en Décembre 2000).
  • Christopheros Nikou. Recalage d'images médicales multimodales : approches par fonctions de similarité robustes et modèles déformables sous contraintes statistiques (thèse : soutenue en Juin 1999).

Publications - Ouvrages

  • 75 publications dans des revues internationales avec comité de lecture.
  • 270 communications ou posters dans des congrès internationaux ou nationaux.
  • Co-auteur de 3 ouvrages (Le système d'exploitation Unix - 1993 ; Unix. Cours et exercices corrigés - 1999 ; Linux - 2000).
  • ISI Web of knowledge 2017 (156 articles, H-index : 21)
  • liste des publications

Enseignement - Formation

  • Cours informatique 1ième année école d’ingénieur Telecom Physique (Langage C - Unix) (supports cours)
  • Cours informatique 1ième année école d’ingénieur Telecom Physique (Option 1A - Unix) (supports cours)
  • Cours informatique 2ième année école d’ingénieur Telecom Physique (Unix) (supports cours)
  • Cours traitement images médicales 3ième année école ingénieur Telecom Physique, master recherche IRIV. (supports cours)
  • Cours traitement images médicales 2ième et 3ième année école ingénieur Telecom Physique spécialisé TIC-Santé. (supports cours)

(supports cours)

Responsabilités scientifiques et administratives

  • Responsable de l'équipe de recherche Imagerie Multimodale Intégrative en Santé (IMIS) de Icube.
  • Directeur de la plateforme d'imagerie "Imagines" de ICube.
  • Responsable de l'équipe de recherche Imagerie in vivo du LINC (2007-2012).
  • Responsable de l'équipe de recherche "traitement images médicales" du laboratoire de Neuroimagerie In Vivo - UMR 7004 (1994-2006).
  • Responsable du service informatique de la Faculté de médecine de Strasbourg (1982-1992).
  • Membre du bureau de ICube.
  • Membre élu de la commission paritaire d'établissement (CPE) de l'UdS.
  • Membre élu de la commission administrative paritaire nationale (CAPN).
  • Membre du comité de pilotage scientifique du centre d'investigation clinique (CIC) de Strasbourg.
  • Membre du comité directeur du FHU "NEUROGENΨCS" de l'hopital de Strasbourg.
  • Membre du comté scientifique des Férérations de Recherche "Neuropole" et "FMTS" de strasbourg.
  • Membre du comité d'aide au montage du MDC (Medical Data Center)
  • Membre du comité de pilotage de IRMC.
  • Membre du comité de pilotage de ICube (2011-2012).

Distinction

  • Chevalier dans l’ordre des Palmes Académiques depuis 2015.
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